Алгоритм учёных Сколтеха усовершенствовал молекулярные ножницы CRISPR
Ключевыми элементами технологии генетического редактирования CRISPR являются «гидовые», или наводящие, РНК, а также белок Cas9, который разрезает ДНК в определённом участке. Однако наводящая РНК не всегда попадает в цель, а значит может неверно направить молекулярные ножницы.
Учёные Сколтеха решили исправить это, увеличив точность инструмента CRISPR/CAS за счёт глубокого обучения, гауссовских процессов и других методов. В результате была создана серия нейросетей, представляющих собой математические модели, реализованные в последовательном умножении матриц. Нейросеть способна обучаться: в тренировочном режиме её память изменяется с учётом вводных данных.
Это позволяет новому алгоритму оценивать вероятности разреза ДНК-мишеней в правильных участках для гидовых РНК. Инструмент может применяться в любых технологиях, основанных на молекулярных ножницах CRISPR/CAS.
«Результаты нашей работы могут быть применимы в любом приложении технологий, которые основаны на CRISPR/Cas, будь то терапия генетических заболеваний, агротехнологии, или эксперименты в фундаментальных научных исследованиях», — рассказывает аспирант Сколтеха Богдан Кириллов, один из создателей нового метода.
Фото: ITC
Наука
Антон Тальский
«Алиса» от «Яндекса» подготовила уникальные новогодние функции
Учёные вскрыли мумию Аменхотепа I посредством цифровых технологий
